1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Wykres wulkaniczny

Teraz stworzysz wykres wulkaniczny, który pozwoli zwizualizować skalę różnicowej ekspresji w badaniu białaczki. Na osi Y wykresu znajdą się logarytmiczne szanse różnicowej ekspresji, a na osi X – logarytmiczna krotność zmian.

Instrukcje

100 XP

W twoim środowisku pracy został wczytany obiekt dopasowanego modelu z rozdziału 2, fit2, dotyczący badania białaczki. Pakiet limma jest już załadowany.

  • Utwórz wykres wulkaniczny wyróżniający 5 najważniejszych genów.

  • Oznacz te 5 genów ich symbolami, przekazując kolumnę symbol z ramki danych fit2$genes do argumentu names.