1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Testowanie różnicowej ekspresji dla 3 grup

Teraz, gdy masz już zdefiniowaną macierz projektu i macierz kontrastów, możesz przystąpić do testowania różnicowej ekspresji.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi hipoksji, macierz projektu (design) oraz macierz kontrastów (cm) zostały wczytane do twojego środowiska pracy.

  • Dopasuj współczynniki modelu za pomocą lmFit.

  • Dopasuj kontrasty za pomocą contrasts.fit.

  • Oblicz statystyki t za pomocą eBayes.

  • Podsumuj wyniki za pomocą decideTests.