1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Tworzenie wykresu pudełkowego z obiektem ExpressionSet

Teraz, gdy wszystkie dane eksperymentalne zostały połączone w jednym obiekcie ExpressionSet, filtrowanie cech i próbek staje się wygodniejsze. W tym ćwiczeniu ponownie utworzysz wykres pudełkowy, aby zwizualizować jeden gen – tym razem zawęzisz też zestaw próbek uwzględnionych na wykresie.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset został wczytany do twojego środowiska roboczego.

  • Ogranicz eset do pierwszych 10 próbek (kolumn).

  • Utwórz wykres pudełkowy dla 1000. genu (czyli wiersza) w eset_sub, korzystając z funkcji dostępowych exprs, pData i fData.