1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Macierz planu eksperymentu

Eksperyment z doksorubicyną to plan czynnikowy 2x2, dlatego musisz utworzyć zmienną łączoną, aby skorzystać z parametryzacji opartej na średnich grupowych.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi doksorubicyny został wczytany do twojego środowiska pracy.

  • Połącz zmienne genotype (WT vs. Top2b null) i treatment (PBS vs. Dox) w jedną zmienną typu factor.

  • Użyj funkcji model.matrix, aby utworzyć macierz planu eksperymentu bez wyrazu wolnego.