1. Uczyć się
  2. /
  3. Courses
  4. /
  5. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R

Connected

Exercise

Macierz kontrastów

Aby zbadać wpływ doksorubicyny na serca myszy dzikiego typu oraz myszy z nokautem Top2b (a także ewentualną interakcję między leczeniem a genotypem), należy skontrastować współczynniki z macierzy projektu.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi doksorubicyny oraz macierz projektu design zostały wczytane do twojego środowiska. Pakiet limma jest już załadowany.

  • Utwórz dox_wt, aby zbadać efekt działania doksorubicyny u myszy dzikiego typu.

  • Utwórz dox_top2b, aby zbadać efekt działania doksorubicyny u myszy z nokautem Top2b.

  • Utwórz człon interakcji, który pozwoli sprawdzić różnice w odpowiedzi na doksorubicynę między dwoma typami myszy (podpowiedź: skontrastuj dox_top2b i dox_wt).