Wizualizacja efektów partii

W eksperymencie na węchowych komórkach macierzystych zastosowano 7 warunków traktowania, każdy z 4 replikatami, co daje łącznie 28 próbek. Próbki te były jednak przetwarzane w 4 oddzielnych partiach. Efekt warunków traktowania jest istotny biologicznie, natomiast efekt partii to szum techniczny. Korzystając z redukcji wymiarowości, określ, który z tych dwóch efektów miał większy wpływ na dane ekspresji genów.

Obiekt ExpressionSet eset z danymi węchowych komórek macierzystych został wczytany do twojego środowiska roboczego.

Użyj funkcji plotMDS, aby zwizualizować główne składowe. Oznacz próbki zgodnie z zastosowanym warunkiem traktowania i ustaw argument gene.selection na "common".
Ponownie zwizualizuj główne składowe, tym razem oznaczając próbki według przynależności do partii.

연습 문제

Wizualizacja efektów partii

지침

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}연습 문제

지침

연습 문제