Tworzenie wykresów pudełkowych
Przeanalizuj zbiór danych dotyczący białaczki, wizualizując poziomy ekspresji pierwszego genu za pomocą wykresów pudełkowych – osobno dla pacjentów ze stabilną i postępującą białaczką.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Instrukcje do ćwiczenia
Macierz ekspresji (x), dane cech (f) oraz dane fenotypowe (p) są wczytane do twojego środowiska pracy.
Wybierz z
xtylko pierwszy gen (tj. pierwszy wiersz) i wstaw go po lewej stronie~w formule (oś Y).Wybierz z
ptylko kolumnę"Disease"i wstaw ją po prawej stronie~w formule (oś X).Wybierz z
ftylko pierwszy gen (tj. pierwszy wiersz) oraz kolumnę"symbol". Użyj tego jako argumentumaindla tytułu wykresu.
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)