1. Học hỏi
  2. /
  3. Khoa Học
  4. /
  5. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R

Connected

Bài tập

Normalizacja

Surowe dane ekspresji genów są nieuporządkowane – wiele genów może nie mieć znaczenia dla badanego układu. Po otrzymaniu nowego zbioru danych pierwszym krokiem jest wizualizacja danych i wykonanie niezbędnych kroków wstępnego przetwarzania.

Hướng dẫn

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset_raw z surowymi danymi Populus został wczytany do twojego środowiska pracy.

  • Użyj funkcji plotDensities, aby zwizualizować rozkład poziomów ekspresji genów dla każdej próbki. Wyłącz legendę.

  • Wykonaj transformację logarytmiczną pomiarów i ponownie je zwizualizuj.

  • Przeprowadź normalizację kwantylową pomiarów przy użyciu normalizeBetweenArrays i ponownie zwizualizuj wyniki.