1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Definiowanie modelu liniowego do porównania 2 grup

Aby zidentyfikować geny z różnicową ekspresją w eksperymencie dotyczącym białaczki, musisz zapisać następujący model liniowy w R:

gdzie \(X_{1}\) jest równe 1 dla nowotworów progresywnych i 0 dla nowotworów stabilnych (uwaga: R automatycznie wybiera warunek bazowy w kolejności alfabetycznej).

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi białaczki został wczytany do twojego środowiska roboczego.

  • Użyj funkcji model.matrix, aby zbudować macierz projektu z wyrazem wolnym oraz współczynnikiem wskazującym status choroby.