1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Testowanie różnicowej ekspresji między 2 grupami

Masz już obiekt ExpressionSet oraz macierz projektową – możesz teraz dopasować model i przetestować go za pomocą limma.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi białaczki oraz macierz projektowa, którą właśnie utworzyłeś (design), zostały wczytane do twojego środowiska pracy.

  • Dopasuj współczynniki modelu za pomocą lmFit.

  • Oblicz statystyki t za pomocą eBayes.

  • Podsumuj wyniki za pomocą decideTests.

  • Ponieważ testowanie wyrazu wolnego nie ma sensu, podaj współczynnik "Diseasestable" podczas uruchamiania decideTests.