1. Uczyć się
  2. /
  3. Courses
  4. /
  5. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R

Connected

Exercise

Macierz kontrastów dla 3 grup

Aby zidentyfikować geny różnicowo ekspresjonowane między każdym z 3 poziomów tlenu, musisz zdefiniować 3 kontrasty parami.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi hipoksji oraz macierz modelu, którą właśnie utworzyłeś (design), zostały wczytane do twojego środowiska.

  • Użyj makeContrasts, aby zdefiniować 3 kontrasty parami. Pamiętaj, aby korzystać z nazw kolumn macierzy modelu bez użycia cudzysłowów.