Exercise

Testowanie różnicowej ekspresji

Mając gotową macierz projektu i macierz kontrastów, możesz przetestować różnicową ekspresję wywołaną przez doksorubicynę u dwóch typów myszy.

Instrukcje

100 XP

W przestrzeni roboczej masz załadowany obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi doksorubicyny, macierz projektu design oraz macierz kontrastów cm. Pakiet limma jest już wczytany.

Dopasuj współczynniki modelu za pomocą lmFit.
Dopasuj kontrasty za pomocą contrasts.fit.
Oblicz statystyki t za pomocą eBayes.
Podsumuj wyniki, używając decideTests i vennDiagram.

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}Exercise

Instrukcje

Exercise