1. Uczyć się
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

Exercise

Tworzenie obiektu ExpressionSet

Zarządzanie trzema oddzielnymi zbiorami danych dla jednego eksperymentu jest żmudne i podatne na błędy – szczególnie gdy trzeba filtrować dane. Połącz trzy zbiory danych z eksperymentu dotyczącego białaczki w jeden spójny obiekt, korzystając z klasy ExpressionSet dostępnej w Bioconductor.

Instrukcje

100 XP

W twoim środowisku pracy załadowane są: macierz ekspresji (x), dane cech (f) oraz dane fenotypowe (p).

  • Utwórz nowy obiekt ExpressionSet za pomocą funkcji ExpressionSet.

  • Przekaż macierz ekspresji do argumentu assayData.

  • Przekaż ramkę danych fenotypowych do argumentu phenoData.

  • Przekaż ramkę danych cech do argumentu featureData.