1. Învăţa
    2. /
  2. Courses
    3. /
  3. Analiza różnicowej ekspresji genów z limma w R
Connected

exercise

Macierz projektu dla modelu średnich grupowych

W poprzednim rozdziale testowałeś dane dotyczące białaczki pod kątem różnicowej ekspresji, używając tradycyjnej parametryzacji kontrastów względem grupy referencyjnej. Jako pierwszy krok w nauce bardziej elastycznej parametryzacji opartej na średnich grupowych ponownie przetestujesz te dane, aby potwierdzić, że uzyskujesz te same wyniki.

Instrucțiuni

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset z danymi dotyczącymi białaczki został wczytany do twojego środowiska pracy.

  • Użyj model.matrix, aby utworzyć macierz projektu bez wyrazu wolnego. Pamiętaj, że zmienna będąca przedmiotem analizy (nowotwory postępujące vs. stabilne) znajduje się w kolumnie Disease ramki danych fenotypowych.