Exercise

Filtrowanie genów

Po przekształceniu logarytmicznym i normalizacji kwantylowej danych należy usunąć geny o niskim poziomie ekspresji, które nie są istotne dla badanego układu.

Instrukcje

100 XP

Obiekt ExpressionSet eset_norm z znormalizowanymi danymi dla gatunku Populus został wczytany do twojego środowiska pracy.

Użyj funkcji plotDensities, aby zwizualizować rozkład poziomów ekspresji genów dla każdej próbki. Wyłącz legendę.
Użyj funkcji rowMeans, aby wskazać geny o średnim poziomie ekspresji większym niż 5. Nadaj temu wektorowi logicznemu nazwę keep.
Przefiltruj geny (czyli wiersze) obiektu ExpressionSet za pomocą wektora logicznego keep i ponownie zwizualizuj dane.

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}Exercise

Instrukcje

Exercise