1. Learn
    2. /
  2. Kurser
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

övning

Vulkanický graf

Teď vytvoříš vulkanický graf, který vizualizuje míru diferenciální exprese ve studii leukémie. Na ose y se zobrazí log odds diferenciální exprese, na ose x pak log fold change.

Instruktioner

100 XP

V pracovním prostředí máš načtený objekt fitovaného modelu ze studie leukémie z kapitoly 2, fit2. Balíček limma je už také načtený.

  • Vytvoř vulkanický graf, který zvýrazní 5 nejvýznamnějších genů.

  • Tyto geny označ jejich genovými symboly – předej sloupec symbol z datového rámce fit2$genes argumentu names.