1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Test diferenciální exprese mezi 2 skupinami

Teď, když máš objekt ExpressionSet a matici designu, můžeš s limma fitovat a testovat svůj model.

Pokyny

100 XP

Objekt ExpressionSet eset s leukemickými daty a matice designu, kterou jsi právě vytvořil/a (design), jsou načteny ve tvém pracovním prostředí.

  • Fituj koeficienty modelu pomocí lmFit.

  • Vypočítej t-statistiky pomocí eBayes.

  • Shrň výsledky pomocí decideTests.

  • Protože testování interceptu nedává smysl, zadej při volání decideTests koeficient "Diseasestable".