1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Designová matice

Experiment s doxorubicinem využívá faktoriální design 2x2, takže pro parametrizaci skupinových průměrů budeš muset vytvořit kombinovanou proměnnou.

Pokyny

100 XP

Do tvého pracovního prostředí byl načten objekt eset typu ExpressionSet s daty z experimentu s doxorubicinem.

  • Zkombinuj proměnné genotype (WT vs. Top2b null) a treatment (PBS vs. Dox) do jedné faktorové proměnné.

  • Pomocí model.matrix vytvoř designovou matici bez interceptu.