1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Krabicový graf pro Top2b

Teď si proveďme rychlou kontrolu: vytvoř krabicový graf hladiny exprese Top2b a ověř, že myši s nulovou mutací mají nižší hladiny exprese Top2b.

Podobný krabicový graf jsi vytvářel/a v kapitole 1, cvičení 4.

Pokyny

100 XP

Do tvého pracovního prostoru byl načten objekt eset typu ExpressionSet s daty o doxorubicinu.

  • Najdi řádek obsahující data pro Top2b tak, že prohledáš sloupec příznaků "symbol" a vyhledáš v něm "Top2b".

  • Vytvoř krabicový graf pomocí formulové syntaxe. Hladina exprese patří na levou stranu od ~, proměnná genotypu na pravou.

  • Předej řádek datového rámce příznaků argumentu main, aby se nastavil název grafu.