1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Definování lineárního modelu pro porovnání 2 skupin

Abys pro leukemický experiment identifikoval/a diferenciálně exprimované geny, potřebuješ přeložit do R následující lineární model:

kde \(X_{1}\) je rovno 1 pro progresivní nádory a 0 pro stabilní nádory (poznámka: R vybírá základní podmínku automaticky podle abecedního pořadí).

Pokyny

100 XP

Do tvého pracovního prostředí byl načten objekt eset typu ExpressionSet s leukemickými daty.

  • Pomocí model.matrix vytvoř matici návrhu s interceptovým koeficientem a koeficientem označujícím stav onemocnění.