1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Vytvoření objektu ExpressionSet

Spravovat 3 oddělené datové sady pro jeden experiment je zdlouhavé a náchylné k chybám – zvláště když potřebuješ provést filtrování. Spoj 3 datové sady z experimentu s leukémií do jednoho uceleného objektu pomocí třídy ExpressionSet z Bioconductoru.

Pokyny

100 XP

V prostředí máš načtenu matici expresí (x), data o prvcích (f) a data o fenotypu (p).

  • Vytvoř nový objekt ExpressionSet pomocí funkce ExpressionSet.

  • Předej matici expresí argumentu assayData.

  • Předej datový rámec s fenotypovými daty argumentu phenoData.

  • Předej datový rámec s daty o prvcích argumentu featureData.