Exercise

Normalizace

Surová data genové exprese jsou zpravidla neuspořádaná – mnoho genů navíc nebude pro zkoumaný systém vůbec relevantních. Po obdržení nové datové sady je proto prvním krokem vizualizace dat a provedení nezbytných kroků předzpracování.

Instructions

100 XP

Do tvého pracovního prostředí byl načten objekt ExpressionSet eset_raw se surovými daty populačního souboru Populus.

Pomocí plotDensities vizualizuj rozložení úrovní genové exprese pro každý vzorek. Legendu skryj.
Proveď logaritmickou transformaci naměřených hodnot a vizualizaci zopakuj.
Normalizuj naměřené hodnoty pomocí kvantilové normalizace funkcí normalizeBetweenArrays a vizualizaci proveď znovu.

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}Exercise

Instructions

Exercise