1. 학습
    2. /
  2. 강의
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

연습 문제

Zjisti zdroje variability

Teď použiješ analýzu hlavních komponent, abys zjistil/a, co je zdrojem variability v datech. Seskupují se vzorky podle genotypu (WT vs. Top2b null) nebo podle způsobu léčby (PBS vs. Dox)?

지침

100 XP

Do tvého pracovního prostředí byl načten objekt eset typu ExpressionSet s daty o doxorubicinu. Balíček limma je již načtený.

  • Pomocí plotMDS vykresli hlavní komponenty. Vzorky označ jejich genotypem.

  • Znovu vizualizuj hlavní komponenty, tentokrát vzorky označ podle způsobu léčby.