1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Matice designu pro faktoriální design 2x2

V tomto faktoriálním experimentu 2x2, zaměřeném na zkoumání vlivu sucha na růst stromů, byly pěstovány 2 různé typy stromů Populus se 2 různými množstvími vody. Aby měl každý koeficient modelu přiřazenou právě jednu skupinu, je potřeba nejprve sloučit obě proměnné dohromady.

Pokyny

100 XP

Do tvého pracovního prostoru byl načten objekt eset typu ExpressionSet s daty Populus.

  • Slouč proměnné type (typ stromu) a water (normální vs. sucho) do jedné faktorové proměnné.

  • Pomocí model.matrix vytvoř matici designu bez interceptu.