1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Test diferenciální exprese pro 3 skupiny

Teď, když máš definovanou matici designu i matici kontrastů, můžeš přistoupit k testování diferenciální exprese.

Pokyny

100 XP

V pracovním prostředí máš načtený objekt ExpressionSet eset s daty z hypoxického experimentu, matici designu (design) a matici kontrastů (cm).

  • Přizpůsob koeficienty modelu pomocí lmFit.

  • Přizpůsob kontrasty pomocí contrasts.fit.

  • Vypočítej t-statistiky pomocí eBayes.

  • Shrň výsledky pomocí decideTests.