1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Volcano plot

Teď vizualizuješ míru diferenciální exprese pro každý kontrast pomocí volcano plotu, který na ose y zobrazuje log odds diferenciální exprese a na ose x log fold change.

Pokyny

100 XP

Do tvého pracovního prostoru byl načten objekt fitted modelu fit2. Balíček limma je už načtený.

  • Z datového rámce fit2$genes získej symboly genů (symbol).

  • Vytvoř volcano plot, který zvýrazní 5 nejlepších genů pro každý ze 3 kontrastů.