Vytvoř krabicový graf
Prozkoumej datovou sadu leukémie vizualizací hladin exprese prvního genu pomocí krabicových grafů – zvlášť pro pacienty se stabilní a progresivní leukémií.
Toto cvičení je součástí kurzu
Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Pokyny k cvičení
V tvém pracovním prostředí jsou načteny: matice exprese (x), data o příznaků (f) a fenotypová data (p).
Z
xvyber pouze první gen (tj. první řádek) a vlož ho vlevo od~ve vzorci (osa y).Z
pvyber pouze sloupec"Disease"a vlož ho vpravo od~ve vzorci (osa x).Z
fvyber první gen (tj. první řádek) a sloupec"symbol". Použij to jako argumentmainpro název grafu.
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)