1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza diferenciální exprese pomocí limma v R
Connected

cvičení

Test diferenciální exprese pro faktoriální design 2x2

I když máš tentokrát více kontrastů než v předchozích příkladech, testování diferenciální exprese pomocí limma využívá stále stejný postup.

Pokyny

100 XP

V pracovním prostředí máš načtený objekt ExpressionSet eset s daty Populus, matici designu (design) a matici kontrastů (cm).

  • Odhadni koeficienty modelu pomocí lmFit.

  • Přizpůsob kontrasty pomocí contrasts.fit.

  • Vypočítej t-statistiky pomocí eBayes.

  • Shrň výsledky pomocí decideTests.