1. 学ぶ
    2. /
  2. コース
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

演習

Ma trận thiết kế cho 3 nhóm

Trong thí nghiệm thiếu oxy (hypoxia), các tế bào gốc được phơi nhiễm với 3 mức oxy khác nhau: 1%, 5% và 21%. Để so sánh chức năng tế bào trong 3 môi trường này, hãy dùng tham số hóa theo trung bình nhóm (group-means parametrization) để chỉ định một mô hình tuyến tính có một hệ số cho mỗi mức oxy.

指示

100 XP

Đối tượng ExpressionSet eset chứa dữ liệu hypoxia đã được nạp vào không gian làm việc của bạn.

  • Dùng model.matrix để tạo một ma trận thiết kế không có hệ số chặn. Nhớ rằng biến quan tâm cho nghiên cứu này (3 mức oxy) nằm ở cột oxygen của khung dữ liệu kiểu hình (phenotype data frame).