1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

Bài tập

Tạo một đối tượng ExpressionSet

Việc quản lý 3 bộ dữ liệu khác nhau cho một thí nghiệm vừa tốn công vừa dễ sai, đặc biệt khi bạn cần lọc dữ liệu. Hãy kết hợp 3 bộ dữ liệu từ thí nghiệm bệnh bạch cầu thành một đối tượng thống nhất bằng cách dùng lớp ExpressionSet của Bioconductor.

Hướng dẫn

100 XP

Ma trận biểu hiện (x), dữ liệu đặc trưng (f), và dữ liệu kiểu hình (p) đã được nạp vào không gian làm việc của bạn.

  • Tạo một đối tượng ExpressionSet mới bằng hàm ExpressionSet.

  • Truyền ma trận biểu hiện vào đối số assayData.

  • Truyền data frame kiểu hình vào đối số phenoData.

  • Truyền data frame đặc trưng vào đối số featureData.