1. 학습
    2. /
  2. 강의
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

연습 문제

Ma trận tương phản

Để kiểm định tác động của doxorubicin lên tim của chuột hoang dại và chuột mất gen Top2b (và mọi tương tác giữa xử lý và kiểu gen), bạn cần đối chiếu các hệ số từ ma trận thiết kế.

지침

100 XP

Đối tượng eset kiểu ExpressionSet chứa dữ liệu doxorubicin và ma trận thiết kế design đã được nạp vào không gian làm việc của bạn. Gói limma cũng đã được nạp.

  • Tạo dox_wt để kiểm định tác động của doxorubicin ở chuột hoang dại (wild type).

  • Tạo dox_top2b để kiểm định tác động của doxorubicin ở chuột mất gen Top2b (Top2b null).

  • Tạo một hạng tương tác để kiểm định sự khác biệt trong đáp ứng với doxorubicin giữa hai loại chuột (gợi ý: lấy tương phản giữa dox_top2b và dox_wt).