Tạo biểu đồ hộp (boxplot)
Khám phá bộ dữ liệu bệnh bạch cầu bằng cách trực quan hóa mức biểu hiện của gene đầu tiên với các biểu đồ hộp cho các bệnh nhân có bệnh bạch cầu ổn định và tiến triển.
Bài tập này là một phần của khóa học
Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Hướng dẫn bài tập
Ma trận biểu hiện (x), dữ liệu đặc trưng (f), và dữ liệu kiểu hình (p) đã được nạp vào không gian làm việc của bạn.
Subset
xđể chỉ lấy gene (tức hàng) đầu tiên và chèn nó vào bên trái dấu~trong công thức (trục y).Subset
pđể chỉ lấy cột"Disease"và chèn nó vào bên phải dấu~trong công thức (trục x).Subset
fđể chỉ lấy gene (tức hàng) đầu tiên và cột"symbol". Dùng giá trị này làm đối sốmaincho tiêu đề biểu đồ.
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)