1. Learn
  2. /
  3. Courses
  4. /
  5. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R

Connected

Exercise

Ma trận thiết kế

Thí nghiệm doxorubicin là một thiết kế nhân tố 2x2, nên bạn sẽ cần tạo một biến kết hợp để dùng trong tham số hóa theo trung bình nhóm.

Instructions

100 XP

Đối tượng ExpressionSet eset chứa dữ liệu doxorubicin đã được nạp vào không gian làm việc của bạn.

  • Kết hợp các biến genotype (WT so với Top2b null) và treatment (PBS so với Dox) thành một biến factor duy nhất.

  • Dùng model.matrix để tạo một ma trận thiết kế không có hệ số chặn (no intercept).