1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

Bài tập

Ma trận thiết kế cho mô hình trung bình theo nhóm

Ở chương trước, bạn đã kiểm định biểu hiện khác biệt trên dữ liệu bệnh bạch cầu bằng cách tham số hóa theo đối sánh điều trị truyền thống. Là bước đầu để học cách tham số hóa linh hoạt hơn theo trung bình nhóm, bạn sẽ kiểm định lại dữ liệu bệnh bạch cầu để xác nhận rằng bạn thu được cùng kết quả.

Hướng dẫn

100 XP

Đối tượng ExpressionSet eset chứa dữ liệu bệnh bạch cầu đã được nạp vào không gian làm việc của bạn.

  • Dùng model.matrix để tạo ma trận thiết kế không có hằng số chặn. Nhớ rằng biến quan tâm của nghiên cứu này (ung thư tiến triển so với ổn định) nằm trong cột Disease của khung dữ liệu kiểu hình (phenotype data frame).