1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

Bài tập

Kiểm tra các nguồn biến thiên

Tiếp theo, bạn cần dùng phân tích thành phần chính để kiểm tra các nguồn biến thiên trong dữ liệu. Các mẫu có gom cụm theo kiểu gen của chúng (WT so với Top2b null) và theo xử lý (PBS so với Dox) không?

Hướng dẫn

100 XP

Đối tượng ExpressionSet eset với dữ liệu doxorubicin đã được nạp vào không gian làm việc của bạn. Gói limma đã được nạp sẵn.

  • Dùng plotMDS để vẽ các thành phần chính. Gắn nhãn các mẫu theo kiểu gen của chúng.

  • Vẽ lại các thành phần chính, lần này gắn nhãn các mẫu theo phương pháp xử lý.