1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. Phân tích Biểu hiện khác biệt với limma trong R
Connected

Bài tập

Kiểm định biểu hiện khác biệt

Giờ bạn đã xác định được ma trận thiết kế và ma trận tương phản, bạn có thể kiểm định biểu hiện khác biệt do điều trị doxorubicin ở hai loại chuột.

Hướng dẫn

100 XP

Đối tượng ExpressionSet eset chứa dữ liệu doxorubicin, ma trận thiết kế design, và ma trận tương phản cm đã được nạp vào không gian làm việc của bạn. Gói limma đã được nạp sẵn.

  • Khớp các hệ số mô hình bằng lmFit.

  • Khớp các tương phản bằng contrasts.fit.

  • Tính các thống kê t bằng eBayes.

  • Tóm tắt kết quả bằng decideTests và vennDiagram.