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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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연습 문제

볼케이노 플롯

다음으로, 백혈병 연구에서 차등 발현의 정도를 시각화하기 위해 볼케이노 플롯을 만들어 볼 거예요. 이 플롯은 y축에 차등 발현의 로그 오즈, x축에 로그 폴드 변화를 표시합니다.

지침

100 XP

2장 백혈병 연구의 적합된 모형 객체 fit2가 작업 공간에 로드되어 있습니다. limma 패키지도 이미 로드되어 있어요.

  • 상위 5개 유전자를 강조하는 볼케이노 플롯을 만드세요.

  • 데이터 프레임 fit2$genes의 symbol 열을 names 인수에 전달해, 상위 5개 유전자를 해당 유전자 기호로 라벨링하세요.