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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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演習

정규화

원시 유전자 발현 데이터는 다소 지저분합니다. 특히 여러분이 연구하는 시스템과 관련 없는 유전자가 많기 때문이에요. 새 데이터 세트를 받으면, 먼저 데이터를 시각화하고 필요한 전처리 단계를 수행해야 합니다.

指示

100 XP

작업 공간에 Populus의 원시 데이터가 담긴 ExpressionSet 객체 eset_raw가 로드되어 있습니다.

  • plotDensities를 사용해 각 샘플의 유전자 발현 분포를 시각화하세요. 범례는 비활성화하세요.

  • 측정값을 로그 변환한 뒤 다시 시각화하세요.

  • normalizeBetweenArrays로 분위수 정규화를 수행하고 다시 시각화하세요.