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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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演習

두 집단을 비교하는 선형 모형 지정하기

백혈병 실험에서 차등 발현 유전자를 찾으려면, 아래 선형 모형을 R로 옮겨야 해요:

여기서 $X_{1}$은 진행성 암이면 1, 안정형 암이면 0이에요(참고: R은 알파벳 순으로 자동으로 기준 조건을 선택합니다).

指示

100 XP

백혈병 데이터가 담긴 ExpressionSet 객체 eset이 워크스페이스에 로드되어 있어요.

  • model.matrix를 사용해 절편 계수와 질병 상태를 나타내는 계수를 포함한 설계 행렬을 만드세요.