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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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볼케이노 플롯

이번에는 각 대비(contrast)에 대해 차등 발현 정도를 볼케이노 플롯으로 시각화해 볼 거예요. y축에는 차등 발현의 로그 오즈(log-odds), x축에는 로그 폴드 변화(log fold change)를 표시합니다.

คำแนะนำ

100 XP

적합된 모델 객체 fit2가 작업 공간에 로드되어 있어요. limma 패키지도 이미 로드되어 있습니다.

  • 데이터 프레임 fit2$genes에서 유전자 기호(symbol)에 접근하세요.

  • 3개의 대비 각각에 대해 상위 5개 유전자를 강조 표시하는 볼케이노 플롯을 만드세요.