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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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演習

3개 그룹에서의 차등 발현 검정

이제 디자인 행렬과 대비 행렬을 지정했으니, 차등 발현을 검정해 보세요.

指示

100 XP

저산소증 데이터가 담긴 ExpressionSet 객체 eset, 디자인 행렬(design), 대비 행렬(cm)이 작업 공간에 로드되어 있습니다.

  • lmFit로 모형 계수를 적합하세요.

  • contrasts.fit으로 대비를 적합하세요.

  • eBayes로 t-통계량을 계산하세요.

  • decideTests로 결과를 요약하세요.