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상자 그림 만들기

백혈병 데이터셋을 탐색해 봅시다. 첫 번째 유전자의 발현 수준을, 안정형과 진행형 백혈병 환자별 상자 그림으로 시각화하세요.

이 연습은 강의의 일부입니다

R에서 limma로 하는 차등 발현 분석

강의 보기

연습 안내

표현형 행렬(x), feature 데이터(f), 그리고 phenotype 데이터(p)가 워크스페이스에 로드되어 있습니다.

  • x를 부분 선택해 첫 번째 유전자(즉, 첫 번째 행)만 포함하고, 이를 수식에서 ~의 왼쪽(y축)에 넣으세요.

  • p를 부분 선택해 "Disease" 열만 포함하고, 이를 수식에서 ~의 오른쪽(x축)에 넣으세요.

  • f를 부분 선택해 첫 번째 유전자(즉, 첫 번째 행)와 "symbol" 열만 포함하세요. 이 값을 그래프 제목을 위한 main 인수로 사용하세요.

실습형 인터랙티브 연습

이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)
코드 편집 및 실행