상자 그림 만들기
백혈병 데이터셋을 탐색해 봅시다. 첫 번째 유전자의 발현 수준을, 안정형과 진행형 백혈병 환자별 상자 그림으로 시각화하세요.
이 연습은 강의의 일부입니다
R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
연습 안내
표현형 행렬(x), feature 데이터(f), 그리고 phenotype 데이터(p)가 워크스페이스에 로드되어 있습니다.
x를 부분 선택해 첫 번째 유전자(즉, 첫 번째 행)만 포함하고, 이를 수식에서~의 왼쪽(y축)에 넣으세요.p를 부분 선택해"Disease"열만 포함하고, 이를 수식에서~의 오른쪽(x축)에 넣으세요.f를 부분 선택해 첫 번째 유전자(즉, 첫 번째 행)와"symbol"열만 포함하세요. 이 값을 그래프 제목을 위한main인수로 사용하세요.
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)