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  3. R에서 limma로 하는 차등 발현 분석
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연습 문제

3개 그룹을 위한 대조 행렬

세 가지 산소 수준 각각 사이에서 차등 발현된 유전자를 찾으려면, 3개의 쌍별(pairwise) 대조를 정의해야 해요.

지침

100 XP

저산소증 데이터가 담긴 ExpressionSet 객체 eset과 방금 생성한 설계 행렬(design)이 작업 공간에 로드되어 있어요.

  • makeContrasts를 사용해 3개의 쌍별 대조를 정의하세요. 설계 행렬의 열 이름을 따옴표 없이 그대로 사용해야 한다는 점을 기억하세요.