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  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
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연습 문제

ボルケーノプロット

次に、白血病研究における発現差の大きさを可視化するためにボルケーノプロットを作成します。これは、y軸に差次的発現の対数オッズ、x軸に対数フォールドチェンジを表示します。

지침

100 XP

Chapter 2 の白血病研究の当てはめ済みモデルオブジェクト fit2 がワークスペースに読み込まれています。limma パッケージも読み込み済みです。

  • 上位5つの遺伝子をハイライトするボルケーノプロットを作成してください。

  • データフレーム fit2$genes の列 symbol を引数 names に渡し、上位5つの遺伝子に遺伝子シンボルのラベルを付けてください。