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  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
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演習

3群のコントラスト行列

3つの酸素レベルそれぞれの間で差次的に発現している遺伝子を特定するには、3つのペアワイズ・コントラストを定義する必要があります。

指示

100 XP

低酸素データを含む ExpressionSet オブジェクト eset と、直前に作成したデザイン行列（design）はワークスペースに読み込まれています。

  • makeContrasts を使って、3つのペアワイズ・コントラストを定義してください。デザイン行列の列名は引用符を付けずに使用する点に注意してください。