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Exercise

群平均モデルでの差次的発現の検定

デザイン行列とコントラスト行列を指定できたので、差次的発現を検定できます。

Instrukcje

100 XP

白血病データの ExpressionSet オブジェクト eset、デザイン行列（design）、コントラスト行列（cm）はワークスペースに読み込まれています。

  • lmFit でモデル係数を当てはめます。

  • contrasts.fit でコントラストを当てはめます。

  • eBayes で t 統計量を計算します。

  • decideTests で結果を要約します。群平均モデルには切片項がないため、treatment-contrasts パラメータ化のときのように fit2 をサブセット化する必要はありません。