コントラスト行列
野生型と Top2b 欠損マウスの心臓に対する doxorubicin の効果（および処理と遺伝子型の交互作用）を検定するには、設計行列の係数をコントラストする必要があります。
この演習はコースの一部です
R での limma を用いた Differential Expression 解析
演習の手順
doxorubicin のデータを含む ExpressionSet オブジェクト eset と設計行列 design は、すでにワークスペースに読み込まれています。limma パッケージも読み込まれています。
野生型マウスにおける doxorubicin の効果を検定するために、
dox_wtを作成してください。Top2b 欠損マウスにおける doxorubicin の効果を検定するために、
dox_top2bを作成してください。2種類のマウス間で doxorubicin に対する応答の差を検定するための交互作用項を作成してください（ヒント:
dox_top2bとdox_wtをコントラストします）。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Create a contrasts matrix
cm <- makeContrasts(dox_wt = ___ - ___,
dox_top2b = ___ - ___,
interaction = (___ - ___) - (___ - ___),
levels = design)
# View the contrasts matrix
cm