1. 学ぶ
    2. /
  2. コース
    3. /
  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
Connected

演習

Top2b の箱ひげ図

次に妥当性チェックとして、Top2b の発現量の箱ひげ図を作成し、null マウスで Top2b の発現が低いことを確認します。

第1章の演習4で、これと同様の箱ひげ図を作成したことを思い出してください。

指示

100 XP

ドキソルビシンのデータを含む ExpressionSet オブジェクト eset がワークスペースに読み込まれています。

  • 特徴量データの列 "symbol" を "Top2b" で検索し、Top2b のデータを含む行を見つけてください。

  • 公式記法を使って箱ひげ図を作成します。式では、~ の左側に発現量、右側に遺伝子型（genotype）変数を置きます。

  • プロットのタイトルには、対応する特徴量データフレームの行を main に渡してください。