1. 学ぶ
    2. /
  2. コース
    3. /
  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
Connected

演習

2群を比較する線形モデルを指定する

白血病の実験で差次的に発現する遺伝子を特定するには、次の線形モデルをRに翻訳する必要があります。

ここで、\(X_{1}\) は進行性がんでは 1、安定がんでは 0 です（注：Rはアルファベット順で自動的に基準条件を選びます）。

指示

100 XP

白血病データを含む ExpressionSet オブジェクト eset がワークスペースに読み込まれています。

  • model.matrix を使って、切片項と疾患ステータスを表す係数を持つデザイン行列を作成してください。