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  3. R での limma を用いた Differential Expression 解析
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연습 문제

2つのグループ間での発現差の検定

ExpressionSetオブジェクトとデザイン行列がそろったので、limmaでモデルの当てはめと検定を行いましょう。

지침

100 XP

白血病データの ExpressionSet オブジェクト eset と、直前に作成したデザイン行列（design）はワークスペースに読み込まれています。

  • lmFit でモデル係数を当てはめます。

  • eBayes で t 統計量を計算します。

  • decideTests で結果を要約します。

  • 切片項を検定しても意味がないため、decideTests を実行する際は係数 "Diseasestable" を指定してください。